Ctitoria voievodului Ștefan cel Mare de la Popăuți, are din anul 2002 un Paraclis
Paraclisul Mănăstirii Popăuţi din Botoşani
Acesta a fost conceput în ideea de a salva ceea ce se află în biserica-monument, ctitorită de Binecredinciosul Voievod Ştefan cel Mare şi Sfânt. Lucrările lăcaşului de închinăciune au început în luna iunie a anului 2002, când s-a pus piatra de temelie. În doar cinci luni s-a zidit toată biserica, astfel că, pe 6 decembrie 2002, Preafericitul Părinte Daniel, Patriarhul Bisericii Ortodoxe Române, în vremea arhipăstoririi ca Mitropolit al Moldovei şi Bucovinei, a slujit Sfânta Liturghie în sfântul locaş. Biserica nu are turlă, fiind concepută după stilul ştefanian, iar pictura încearcă să redea anumite scene din vechea biserică, aflată în apropiere.
Sfințirea Paraclisului „Acoperământul Maicii Domnului”
În ziua de 4 mai 2014, în istoria Mănăstirii Popăuţi din municipiul Botoşani s-a mai scris o filă, una încărcată de frumuseţea şi măreţia slujbei de sfinţire a noii biserici cu hramul „Acoperământul Maicii Domnului“, ce a fost oficiată de Înaltpreasfinţitul Părinte Teofan, Mitropolitul Moldovei şi Bucovinei, înconjurat de alţi patru ierarhi, dar şi de numeroşi preoţi slujitori, atât din Arhiepiscopia Iaşilor, cât şi din alte eparhii ale ţării noastre. Slujba de sfinţire a noii biserici cu hramul „Acoperământul Maicii Domnului“ a Mănăstirii Popăuţi din Botoşani, lăcaş de cult zidit în 2002, cu binecuvântarea Preafericitului Părinte Patriarh Daniel, pe atunci Mitropolit al Moldovei si Bucovinei, a fost oficiată de cinci ierarhi: Înaltpreasfinţitul Teofan, Mitropolitul Moldovei şi Bucovinei, Înaltpreasfinţitul Iosif, Mitropolitul ortodox român al Europei Occidentale şi Meridionale, Preasfinţitul Varlaam Ploieşteanul, Episcop-vicar patriarhal, delegatul la eveniment al Preafericitului Părinte Patriarh Daniel, Preasfinţitul Ioachim Băcăuanul, Episcop-vicar al Arhiepiscopiei Romanului şi Bacăului, şi Preasfinţitul Emilian Lovişteanul, Episcop-vicar al Arhiepiscopiei Râmnicului.
